当前中药材产业发展面临不少困难和挑战：
　　一是资源过度开发，品种保护压力大。尚未实现人工种养的药材，完全依赖采挖野生资源，野生资源蕴藏量急剧下降，部分野生药材资源濒临枯竭。濒危物种的品种数量日益增多，一些生态型药材由于乱挖滥采导致植被破坏，专保护中药材资源，实现永续利用，任务十分艰巨。
　　二是规划引导不到位，盲目发展问题突出。部分地区中药材产业发展仍然缺乏科学谋划，发展思路不清晰，在非适宜区盲目无序引种扩种道地药材，不考虑中药材的道地性与环境的适应性，造成大量栽培后药材形态改变、药效下降，道地性丧失。
　　三是科技创新不足，质量水平不高。近年来，我国在中药材品种、全程标准化技术模式等方面缺乏突破性研究成果。在品种上，中药材育种研究起步较晚，选育良种种类少，宜推广的产量高、药性强、稳定性好的品种不多。在生产技术上，多数中药材产区的立地条件较差，栽培技术不规范，肥水管理不科学，种植年限不足提前采挖、抢青采收、采收时期错误等影响中药材药效和品质。在质量监管上，中药材生产单元规模小而散，加之基地准出、产品质量追溯等制度不健全，产地环境、投入品和产品检测等环节监管难度较大，一些质量不合格的中药材进入市场。
　　四是产业链条不完善，社会化服务滞后。病虫统防统治、肥料统配统施等社会化服务水平还很低。中药材采后商品化处理能力弱，生产、流通和市场信息监测网络体系尚未建立。
　　五是政策扶持引导不够，持续发展后劲不足。在财政支持方面，对道地药材生产扶持政策和资金不多。在农业保险方面，专用险种少、保额低，应对自然灾害、市场风险能力较弱。在用地方面，各地对耕地用途管控政策认识不统一，影响经营主体投资积极性。
　　做强道地药材特色产业的思路措施：
　　在发展思路上：完整、准确、全面贯彻新发展理念，以中医药与现代农业融合为重点，以提升道地药材供给能力、农民收入增长为目标，以全产业链建设为抓手，立足资源优势，优化区域布局，创新服务机制，推行标准化引领、基地建设带动、科技创新驱动、产业融合促动，加快推进品种培优、品质提升、品牌打造和标准化生产，着力建设一批设施标准、管理规范、特色鲜明的道地药材生产基地，走产出高效、产品安全、资源节约、环境友好的中药材农业现代产业发展之路，做强道地药材特色产业，助力农业强国建设和健康中国战略、乡村振兴战略实施。
　　在工作措施上，做到“五个强化”：
　　（一）强化政策支持，聚力推动中药材产业发展。把发展中药材产业纳入相关规划之中，作为巩固拓展脱贫攻坚成果与乡村振兴有效衔接的重要内容，集聚中药材科研、生产、加工、流通等各方面资源，形成合力，构建政府搭台、企业唱戏、上下联动、多方参与的工作格局。统筹支农资金，加大道地药材生产基地建设投入。创新金融服务，建立多元化投融资机制，吸引社会资本投入道地药材产业发展，打造优势道地药材产业集群。
　　（二）强化规划引导，着力建设道地药材优势区。适区适种是提升中药材道地性的关键。优化道地产区，引导资源集聚，严格道地药材的区域布局，重点巩固提升优势产区。根据自然条件，因地制宜确定主栽品种，充分发挥品种特性，提升产量和品质，避免盲目引种、无序扩种。
　　（三）强化创新驱动，努力提高中药材质量效益。加力推进种业创新，强化新品种保护，鼓励科研机构和企业开展新品种的引进、选育。建设一批道地药材良种繁育基地，推动中药材种子种苗向专业化、商品化、产业化方向发展。加力推进科技创新，依托中药材产业技术体系，开展野生资源保护利用、水肥管理、连作障碍治理、饮片加工等关键技术研究，组装集成一批绿色标准化生产技术模式。加力推进专用农药登记。支持科研教学单位、农药企业开发中药材专用农药新品种，简化审批程序，加快登记进程，解决中药材生产无药可用的问题。
　　（四）强化利益链接，提升组织化程度。发展道地药材特色产业，必须要建立合理的利益联结机制，发展多种形式的适度规模经营。支持中药企业在道地药材优势区建立原料生产基地，鼓励企业构建道地药材原料直供机制，保障数量、提高质量。鼓励中药企业在产地建设加工基地，实现清洁化、连续化、自动化、标准化加工，提升中药材加工水平。推进中药材生产与休闲旅游等一二三产融合发展，弘扬中医中药传统文化，培育和发展中药材新业态新模式，提高综合效益和竞争力。
　　（五）强化品牌打造，提升中药材产品影响力。支持地方依托大型企业集团、产业联盟或行业协会，在中药材主产区创建地域特色突出、产品特性鲜明的区域公用品牌，扩大市场影响力。壮大企业品牌。鼓励企业加快商标注册，提升产品档次，塑造品牌核心价值。搭建品牌产品销售推介平台，通过博览会、展销会、推介会等多种形式，加大营销力度，提升品牌知名度。